Équipe Friant - GMGM - Génétique moléculaire, génomique, microbiologie - Université de Strasbourg

New publication : Monitoring mitochondrial localization of dual localized proteins using a Bi-Genomic Mitochondrial-Split-GFP

Tue, 24 Sep 2024 11:32:02 +0200

Even if a myriad of approaches has been developed to identify the subcellular localization of a protein, the easiest and fastest way remains to fuse the protein to Green Fluorescent Protein (GFP) and visualize its location using fluorescence microscopy. However, this strategy is not well suited to visualize the organellar pools of proteins that are simultaneously localized both in the cytosol and in organelles because the GFP signal of a cytosolic pool of the protein (cytosolic echoform) will inevitably mask or overlay the GFP signal of the organellar pool of the protein (organellar echoform). To solve this issue, we engineered a dedicated yeast strain expressing a Bi-Genomic Mitochondrial-Split-GFP. This split-GFP is bi-genomic because the first ten ß-strands of GFP (GFP_ß1–10) are encoded by the mitochondrial genome and translated by mitoribosomes whereas the remaining ß-strand of GFP (GFP_ß11) is fused to the protein of interest encoded by the nucleus and expressed by cytosolic ribosomes. Consequently, if the GFP_ß11-tagged protein localizes into mitochondria, GFP will be reconstituted by self-assembly GFP_ß1–10 and GFP_ß11 thereby generating a GFP signal restricted to mitochondria and detectable by regular fluorescence microscopy. In addition, because mitochondrial translocases and import mechanisms are evolutionary well conserved, the BiG Mito-Split-GFP yeast strain can be used to probe mitochondrial importability of proteins regardless of their organismal origins and can thus serve to identify unsuspected mitochondrial echoforms readily from any organism.

Spotlight RNA Society: Solène Zuttion

Tue, 24 Sep 2024 11:21:38 +0200

Solène earned her bachelor's and master's degrees from the University of Strasbourg, where she was inspired by exceptional biochemistry and genetics teachers such as Dr. Evelyne Myslinski, Prof. Philippe Carbon, and Prof. Serge Potier. "I also had a lot of structural biology courses, which insisted that the determination of the 3D structure of macromolecular complexes is essential to better understand at the atomic scale cellular processes in health and diseases." During her undergraduate years, Solène had the opportunity to work in Dr. Sylvie Friant's lab, using Saccharomyces cerevisiae as a model to study centronuclear myopathies, which ignited her passion for molecular biology and biochemistry.

Currently, Solène is engaged in a Ph.D. project under the mentorship of Professor Hubert Becker and Dr. Sylvie Friant at IMCBio. Her research focuses on the dynamics and plasticity of the aminoacyl-tRNA synthetases, particularly the S. cerevisiae multi aminoacyl-tRNA synthetase AME complex. This project involves studying the relocalization and non-canonical functions of this complex, which includes the glutamyl- and methionyl-tRNA synthetases linked to the Arc1 cofactor. "By joining this program, I reached my first goal: an exciting PhD project, extra training, funding for abroad internships and meetings, and opportunities to organize summer schools with other Ph.D. students from the IMCBio graduate school."

"The career path to becoming a researcher is highly competitive, but nothing is impossible or unreachable. I don’t know whether I will accomplish my dream of becoming an academic researcher, but I will push my limits to be one of them!"

Beyond research, Solène is deeply committed to science communication and outreach. "I teach enzymology and biochemistry to third-year bachelor's students. As one of my goals is to continue later with teaching activities besides research, it gives me a real insight into this responsibility, and I adore it!" Solène also participates in science festivals, explaining the use of yeast models to study diseases to school students and families. Additionally, as a member of the Women and Science association, she promotes women in scientific and technical careers by visiting high schools and leading workshops.

Solène's favorite RNA is tRNA, closely tied to her research on aminoacyl-tRNA synthetases. She was particularly fascinated by tRNA-derived fragments (tRFs), a new class of small non-coding RNAs that play critical roles in gene expression regulation. Solène highlights an article from Lluís Ribas de Pouplana's lab published in the RNA Journal, which explores how tRFs regulate Adenosine deaminase acting on transfer RNA (ADAT) and its implications for diseases like microcephaly and epilepsy. She also appreciates the paper by Dr. Benoît Masquida from her own lab, which investigates the unique conformations of UNCG family loops in RNA structures.

Solène emphasizes the importance of continuous learning and the privilege of having access to scientific knowledge. "The team and the persons in it make everything. Without them, I would not be sure to be featured today as an RNA society spotlight and I am more than grateful to them." As she continues her journey in RNA research, Solène remains committed to pushing the boundaries of molecular biology and inspiring future generations of scientists.

Congrès Yeast Lipid Conference

Thu, 13 Jun 2024 10:40:12 +0200

Nos étudiants en thèse, Patricio Aguirre-Pineda et Emelyne Kircher ont présenté respectivement un poster "Interactomic study of Vps15, the regulatory subunit of Vps34 that mediates formation of phosphatidylinositol 3-phosphate" et un selected talk "Triazole exposure on natural isolates yeast of Saccharomyces cerevisiae", au congrès Yeast Lipid Conference 2024 (YLC2024), qui s'est déroulé à Homburg (Sarre) du 29 au 31 mai 2024.

Rencontre MéthaTransfert à la ferme expérimentale de La Bouzule

Thu, 13 Jun 2024 10:14:48 +0200

Cette journée fut rythmée d'échanges fructueux regroupant des socio-économistes (Pascal Grouiez, Nathalie Blanc, Renaud Metereau, Sabina Issehnane, Rehda Fares) et des biologistes (Emelyne Kircher, Sylvie Friant, Bruno Rinaldi, Nathan Roessel), autour du sujet de la méthanisation qui est le coeur d'un projet commun "MéthaTransfert". (https://ensaia.univ-lorraine.fr/fr/Node/122)

Fête de la Science Lingolsheim 6 au 8 octobre 2023

Mon, 23 Oct 2023 16:14:07 +0200

Les membres de l'équipe Friant et Becker ont été impliqués dans divers ateliers :
- environnement: le monde des abeilles et de l'apithérapie
- écologie: la levure pour visualiser l'effet de cocktails de pesticides
- biodiversité: les champignons filamenteux, les observer et les comprendre
- Sciences participatives: Avec le jeu Mendeleieva, découvrez les éléments chimiques de votre vie de tous les jours et des femmes scientifiques étudiant ces éléments.

D'autres ateliers étaient proposés :
- santé: l'effet d'une carence alimentaire (régime) sur la physiologie d'une cellule
- le monde de l'ARN: construisez de l'ARN avec des bases aimantées
- neurosciences: NeuroBioCell, comprendre et observer le fonctionnement des cellules neuronales
- chimie: façonner les molécules pour en faire des micro-machines
- climat: la fresque du climat avec des étudiant-e-s de l'IUT de Schiltigheim
- Physique: l'Année de la Physique avec une exposition de femmes physiciennes
- Comité du Bas-Rhin de La Ligue contre le cancer (Ligue 67): la recherche contre le cancer, L’Agenda scolaire (ma santé, j’en prends soin), comment se protéger du cancer
- Sport dans le cadre des JO2024: Histoire du sport en Alsace

Et des conférences :

Conférence exceptionnelle de Jean-Pierre Sauvage, prix Nobel de chimie 2016

Mercredi 11 octobre à 20h00 : Gymnase Im Sand - Lingolsheim: réservation obligatoire

Rencontre-débat avec des sportifs médaillés et un préparateur physique professionnel

Mercredi 4 octobre à 20h00 : Maison des Arts de Lingolsheim "Science et condition physique : les sportifs de haut niveau", avec des sportifs médaillés et un préparateur physique professionnel (rugby, snowboard, tir paralympique) : avec Sylvain Dufour snowboard (Vainqueur de la Coupe du Monde 2014, Médaille d’argent aux Championnats du Monde 2009, 3 participations aux Jeux Olympiques, 4^ième au JO d’hiver de 2018); Raphaël Voltz, tir à la carabine (Double vice-champion paralympique aux JO Pékin 2008, médaille d'argent JO Londres 2012, Double champion du monde) ; Romain Ritter, Préparateur physique Strasbourg Alsace Rugby. Animée par le Pr Michel Hasselmann.

Comprenez l'apport de la science dans le sport - conférences à la Maison des Arts de Lingolsheim à 20h00 :

3 octobre : "Sport et santé": Cancer et activité physique : Dr Evelyne Lonsdorfer
6 octobre: "Ocytocine : amour, sport et autres addictions sympathiques ...": Pr Marcel Hibert
9 octobre: "Médecine, dopage et sport": Dr John Lenertz
13 octobre: "Sports et Sciences": Créativité, partage et Joie de Vivre: Dr Pierre Antony

Rencontre-débat avec des scolaires sur l'histoire du sport en Alsace

Mardi 10 octobre à 14h30 : Avec Denis Jallat > Responsable du Comité de rédaction « histoire » de la revue Sciences sociales et sport. Sébastien Stumpp > Membre du Comité d’histoire des ministères chargés de la Jeunesse et des Sports (CHMJS) Cathy Blanc-Reibel > Ingénieure CNRS

Pour public scolaire: primaires (CM1/CM2) et collèges - Gymnase Im Sand - Lingolsheim: réservation obligatoire

Table-Ronde: Sports, racisme et neuroscience - les comportements racistes dans le sport

Samedi 7 octobre à 14h00 : Gymnase Im Sand – Lingolsheim : avec Odile Rohmer Professeure en psychologie sociale - Jérôme Beauchez Professeur de sociologie et d'anthropologie à l'Université de Strasbourg - Daouada Ba > Président de la commission sport de la LICRA

Sylvie Friant aux Femin'Days au Lycée Leclerc de Saverne

Tue, 14 Mar 2023 12:37:19 +0100

Fête de la Science 2022 à Lingolsheim

Fri, 04 Nov 2022 14:43:28 +0100

Découvrez le monde fascinant de la recherche à travers des ateliers et des conférences:

- environnement: le monde des abeilles et de l'apithérapie

- santé humaine: la levure de boulanger pour mieux comprendre les maladies génétiques rares

- un autre regard sur l'Art: comment on perçoit une œuvre d'art grâce à l'application Ikonikat

- le monde de l'ARN: construisez de l'ARN avec des bases aimantées

- biodiversité: les champignons filamenteux, les observer et les comprendre

- chimie: façonner les molécules pour en faire des micro-machines

- orientation: découvrir les métiers de la recherche scientifique au CNRS

- 2022 Année du Bicentenaire de la naissance de Louis Pasteur: Louis Pasteur microbiologiste

- Comité du Bas-Rhin de La Ligue contre le cancer (Ligue 67): la recherche contre le cancer, L’Agenda scolaire (ma santé, j’en prends soin), comment se protéger du cancer

- Sciences participatives: Avec le jeu Mendeleieva, découvrez les éléments chimiques de votre vie de tous les jours et des femmes scientifiques étudiant ces éléments.

3 équipes du GMGM ont tenu des strands lors de cet évennement.

Publication Equipe Bahram et Equipe Friant

Tue, 22 Feb 2022 10:13:31 +0100

Amjad Khan, Anne Molitor, Sylvain Mayeur, Gaoqun Zhang, Bruno Rinaldi, Béatrice Lannes, Benoît Lhermitte, Muhammad Umair, Stefan T Arold, Sylvie Friant, Sepand Rastegar, Mathieu Anheim, Seiamak Bahram, Raphael Carapito.

Background: The dystonias are a heterogeneous group of hyperkinetic disorders characterized by sustained or intermittent muscle contractions that cause abnormal movements and/or postures. Although more than 200 causal genes are known, many cases of primary dystonia have no clear genetic cause.

Objectives: To identify the causal gene in a consanguineous family with three siblings affected by a complex persistent generalized dystonia, generalized epilepsy, and mild intellectual disability.

Methods: We performed exome sequencing in the parents and two affected siblings and characterized the expression of the identified gene by immunohistochemistry in control human and zebrafish brains.

Results: We identified a novel missense variant (c.142G>A (NM_032192); p.Glu48Lys) in the protein phosphatase 1 regulatory inhibitor subunit 1B gene (PPP1R1B) that was homozygous in all three siblings and heterozygous in the parents. This gene is also known as dopamine and cAMP-regulated neuronal phosphoprotein 32 (DARPP-32) and has been involved in the pathophysiology of abnormal movements. The uncovered variant is absent in public databases and modifies the conserved glutamate 48 localized close to the serine 45 phosphorylation site. The PPP1R1B protein was shown to be expressed in cells and regions involved in movement control, including projection neurons of the caudate-putamen, substantia nigra neuropil, and cerebellar Purkinje cells. The latter cells were also confirmed to be positive for PPP1R1B expression in the zebrafish brain.

Conclusions: We report the association of a PPP1R1B/DARPP-32 variant with generalized dystonia in man. It might be relevant to include the sequencing of this new gene in the diagnosis of patients with otherwise unexplained movement disorders. © 2021 International Parkinson and Movement Disorder Society.

[Translate to English:] Fête de la science 8 au 10 octobre 2021 Illkich La Villa

Thu, 07 Oct 2021 10:42:00 +0200

A programme : Levures et expression de gènes humains

Comment utiliser des levures pour leur faire produire des gènes humains

Observations :

- au microscope,

- de cultures levures de différentes souches,

- comparaison entre souches Saccharomyces cerevisiae, levure de boulangerie, portant un gène sauvage ou des variants de patients atteints de maladies rares,

- boites de Petri avec des tests d'activité de différents produits issus des abeilles

https://www.fetedelascience.fr/la-recherche-sur-le-campus-d-illkirch-couleurs-microbiologie-biodiversite-et-environnement

Publication Equipe Friant et Becker : CEX1

Thu, 15 Apr 2021 16:31:00 +0200

Ludovic Enkler, Bruno Rinaldi, Johan Owen de Craene, Philippe Hammann, Osamu Nureki, Bruno Senger, Sylvie Friant, Hubert D Becker

COPI (coatomer complex I) coated vesicles are involved in Golgi-to-ER and intra-Golgi trafficking pathways, and mediate retrieval of ER resident proteins. Functions and components of the COPI-mediated trafficking pathways, beyond the canonical set of Sec/Arf proteins, are constantly increasing in number and complexity. In mammalian cells, GORAB, SCYL1 and SCYL3 proteins regulate Golgi morphology and protein glycosylation in concert with the COPI machinery. Here, we show that Cex1, homologous to the mammalian SCYL proteins, is a component of the yeast COPI machinery, by interacting with Sec27, Sec28 and Sec33 (Ret1/Cop1) proteins of the COPI coat. Cex1 was initially reported to mediate channeling of aminoacylated tRNA outside of the nucleus. Our data show that Cex1 localizes at membrane compartments, on structures positive for the Sec33 α-COP subunit. Moreover, the Wbp1 protein required for N-glycosylation and interacting via its di-lysine motif with the Sec27 β'-COP subunit is mis-targeted in cex1Δ deletion mutant cells. Our data point to the possibility of developing Cex1 yeast-based models to study neurodegenerative disorders linked to pathogenic mutations of its human homologue SCYL1.

Biology Open 2021 10: bio058528 doi: 10.1242/bio.058528 Published 22 March 2021

L'équipe Friant retenue pour le projet PHC Tassili 2021

Fri, 26 Feb 2021 16:06:00 +0100

Utilisation de modèles animaux et cellulaire pour évaluer les effets in vivo d'une exposition chronique à des pesticides seuls et en cocktails.

Le partenariat Hubert Curien (PHC) Tassili est un programme de coopération algéro-français qui apporte un soutien à des projets de recherche conjoints sur une durée de 3 ans. Le financement porte notamment sur la mobilité au sein de laboratoires français, de jeunes doctorants algériens et d'enseignants pour une habilitation d'une part, et de la mobilité de chercheurs français et algériens entre la France et l'Algérie d'autre part.

Séverine Bär, aimantée par la spéléo

Mon, 25 Jan 2021 15:58:00 +0100

Séverine Bär, aimantée par la spéléo, article dans l'Actu de l'UNISTRA rédigé par Elsa Collobert

L’indispensable de Séverine : le site plongeesout, « une mine d’informations »

Bruno Rinaldi Responable des ruches de l'Unistra : Ça bourdonne sur les toits de l'Unistra !

Fri, 17 Jul 2020 15:33:00 +0200

Bruno Rinaldi est effectivement ingénieur au laboratoire de Génétique moléculaire, génomique, microbiologie (GMGM, Unistra/CNRS). En tant qu’apiculteur amateur, il est aussi référent pour la convention signée l’an dernier entre l’Unistra et l’association Asapistra, dont il fait partie et qui s’est notamment donné pour mission de diffuser les connaissances autour de l’apiculture auprès du grand public, et de le sensibiliser à une apiculture respectueuse de l’environnement.

Lire l'article dans l'Actu

Idex Attractivité pour Séverine Bär dans l'équipe dirigée par Sylvie Friant

Mon, 02 Mar 2015 11:38:00 +0100

Séverine Bär dans l'équipe Trafic membranaire et signalisation lipidique, dirigée par Sylvie Friant, a obtenu un financement IdEX 2015 - ATTRACTIVITE pour le projet :

La levure, un nouveau modèle pour étudier des gènes du trafic intracellulaire portant des mutations pathologiques induisant des ciliopathies

Sylvie Friant IDEX Contrat Doctoral

Thu, 27 Mar 2014 17:15:00 +0100

Le laboratoire de Sylvie Friant a obtenu un contrat doctoral IDEX pour le sujet : Détermination de la fonction cellulaire de la dynamine 2 (DNM2) responsable de maladies neuromusculaires, en utilisant le modèle de la levure Saccharomyces cerevisiae

ANR-Blanc Equipe Dr Friant

Wed, 31 Jul 2013 11:36:00 +0200

L'équipe Trafic Membranaire et Signalisation Lipidique dirigée par Sylvie Friant a obtenu le soutien du programme ANR-Blanc-2013 pour le projet PI5PACTION. Ce projet visant à mieux comprendre le rôle du lipide PI5P dans différentes pathologie (cancer et myopathie) est réalisé en collaboration avec les équipes de Bruno Goud (Institut Curie, Paris), Bernard Payrastre (I2MC, Toulouse) et Jocelyn Laporte (IGBMC, Illkirch).

Projet Myotubularine financé par l'AFM Téléthon

Tue, 19 Mar 2013 10:47:00 +0100

Financement de l'équipe Trafic Membranaire et Signalisation Lipidique dirigé par Sylvie Friant par l'AFM Téléthon du projet 'Deciphering the molecular specificity of two neuromuscular diseases by using the yeast model system'.